Задание 1
В результате проведенного blastn выяснилось, что данный ген практически наверняка принадлежит Brada inhabilis и является геном гистона H3.
Задание 2
Для всех выравниваний область поиска была ограничена таксоном Opheliidae (taxid:36122)Megablast(42 находки)
Blastn со стандартными настройками(50 находок)
Blastn со своими настройками(47 находок)
Настройки Blastn
Как можно видеть из изображений выше Megablast находит меньшее количество выравниваний но все они все имеют большие E-value, покрытие и идентичность
Задание 3
В этом задании был использован tblastn. В геноме были найдены гомологи генов белков HSP71_YEAST(E-value=0.0, identity=79%, bitscore=921), TBB_NEUCR(E-value=0.0, identity=82%, bitscore=742) и возможный, но менее вероятный гомолог EIF3G_SCHPO(E-value=2e-21, identity=38%, bitscore=95.5)Задание 4
В этом задании использовался blastx. Из полученых выравниваний я выбрал выравнивание с белком MCM-domain-containing protein так как оно показалось наиболее правдоподобным.
Этому белку соответствует ген WALSEDRAFT_59169 из организма Wallemia mellicola, расположение 774954..781112 на комплементарной цепи
Задание 5
Для сравнения я взял два вида рода Chlamydia, а именно Chlamydia pneumoniae (вызывает пневмонию у человека) и Chlamydia muridarum (вызывает пневмонию у мышей). Как видно из карты геномы этих организмов мало похожи, но все же имеют некоторые небольшие схожие учатки.